Три месяца назад Темперанс Бреннан, одна из лучших антропологов в мире, была обвинена в убийстве. Ее подставил Кристофер Пелант – технический гений, который уже был подозреваемым в деле, расследованном Бреннан и Бутом, но сорвался с крючка. В этот раз он не только ушел от правосудия, но и сделал так, что ключевые улики оказались связаны с Бреннан, и это убедило суд в ее причастности. 

В течение этих трех месяцев Бреннан скрывалась от ФБР с помощью своего отца, а Бут и остальные специалисты института Джефферсона изо всех сил старались выследить и поймать Пеланта. С помощью анонимного информатора им удается сделать важный шаг в этом направлении. Когда Бреннан все же возвращается к Буту, становится ясно, что три месяца разлуки не прошли бесследно. Тем временем Ходжинс с Анджелой продолжают доказывать, что с самого начала должны были быть вместе, а Свитс решает предпринять следующий шаг во взаимоотношениях с Дэйзи. А пока все они разбираются с личной жизнью, на работе появляются все новые убийства, которые необходимо раскрыть.